Добрый день, есть ли у кого-то инструцкия как это сделать, почитал пару сайтов, там используется FlashMagic, а где-то говорят, что можно сделать проще. Поделитесь опытом пжл.

Нам сервис ккт прислал файл прошивки, им и прошили.
Каждая прошивка привязана к заводскому номеру кассы.

(1) Каждая прошивка привязана к заводскому номеру кассы.

Прошивка не привязана. Прошивка общая для модели по ИД из зав. номера.
Привязан "обновлятор". Это самораспаковывающийся архив 7-ZIP, в котором содержится программа-прошивальщик, сама прошивка - файл с расширением *.con, с именем по ИД модели (в одном файле обновлятора может быть несколько этих контейнеров, под разные модели), и самое главное, что делает эту прошивку "индивидуальной" - XML файл лицензии. В нем содержится строка(или несколько, если обновлятор для нескольких ККТ) с заводским номером кассы и привязанной к нему лицензией.
Как-то так:
корень архива:



Каталог p5:

(2) а откуда берутся эти файлы и архивы?

(3) Скачиваются из ЛК АТОЛа. Платно.
Раньше, год или два назад, можно былро скачать разовое обновление, теперь, эту лавочку прикрыли - только по подписке(ИТС, типа как у 1С), сроком минимум на год...
Более того, из ЛК в некоторых случаях, если "не все совсем запущено", можно и прямо из ЛК обновить, "по воздуху". Иногда прокатывает. А не получилось - скачиваете файл, запускаете и обновляете локально.
Но, еще раз - надо понимать, что у Вас сейчас там... А то может там все на столько древнее, что без разборки и манипуляции с джамперами первый раз и не получится.