Есть ПКО, созданный на основании приобретения товаров и услуг. В превью чека ККМ показывает только общую сумму. Где-то есть настройка печати в разрезе номенклатуры?

нет настроек. ПКО должен иметь основание заказ клиента или накладная

На основании реализации, конечно.

(2)Признак способа расчёта в чеке какой? Передача с полной оплатой?

Выяснилась вот какая особенность. Если в реализации стоит галка "сводный счет-фактура", то бьётся общей суммой.

Выяснилась ещё одна особенность. В базе клиента учёт номенклатуры заменён. В результате чек печатается не с теми позициями. Может кто-то переделывал печать и может подсказать, в какой точке кода можно перехватить заполнение чека?

В УТ11.4, а значит и в КА 2.4 модно в ДенежныеСредстваСервер
в УТ11.5 и КА 2.5 по моему не прокатит

(6) Но ведь есть место, где можно подменить ТЗ или откуда позиции в чеке берутся?

(7)я Вам и написал где можно было в УТ11.4. В этом общем модуле. Процедуру сами можете найти