Пример. Есть справочник "Наборы". Ему подчинен справочник "ВендорыНаборов".
Для элемента справочника "Наборы" можно задать таблицу вендоров, а как сделать это для группы?

Что то я не помню, а что группе нельзя назначить подчиненый справочник?

можно, задавай

Когда открываешь подчиненный справочник для группы вверху отображается, что не задан элемент-владелец

Нельзя. Можно сделать справочник вендоров не подчиненным, с реквизитом "Набор" и отбором по нему. И в этом реквизите выбирать группу наборов.