Есть проблема с партиями, реализация раньше поступления, документы менять нельзя. Мне предлагают сделать дополнительные поступления и реализации в указанный период на недостающее количество, чтобы минуса ушли. Насколько это правильно? Есть ли обработки, которые что-то подобное делают, если да, то дайте ссылку?

Можно документом корректировки регистров. Если в пределах месяца, я бы не парился.

(1) Это вам не УТ11, тут стоит парится. Но с Корректировкой регистров согласен

(0) Много таких?
Можно так: поставить поступление датой ДО реализации, восстановить партии, вернуть поступление в правильную дату.

(3)
"восстановить партии" - это куда нажать?

(4) Хоть вы и красотка, но партиями заниматься должен специалист. Который понимает про принятый на фирме способ списания партий ("онлайн" при проведении документов реализации или обработкой), способ учета - по среднему или ФИФО. И после этого решать, что делать.