Зависит от нагрузки. Я предполагаю 1С с 50-100 пользователями.
И то и другое серверный диск с большим ресурсом.
Я бы выбрал более дешевый SATA. Заметной разницы в производительности скорее всего не будет. Держать диск под замену SATA проще потому что он дешевле.
По возможности два диска RAID + один горячий резерв + один на складе.
Я бы пытался минимизировать количество типоразмеров дисков в пределах организации если это возможно.