Трудно сбиться тому - чего нет.
По факту нет никаких остаток отпусков, есть первоначальные данные, списание по кадровым или расчетным документам и расчетный остаток.
В первую очередь - обновление, многие разработчики "дорабатывают" подсистему остатков отпусков - может снесли.
Далее смотрите на учетную политику, может переставили флаг с учета по кадровым на расчетные документы.
Здесь можно обсудить любую тему при этом оставаясь на форуме для 1Сников, который нужен для работы. Ymryn