Подскажите, что где надо настроить, чтобы у пользователя документы фильтровались по значению справочника

Да

Какого справочника?

(2) Валюты

Давайте уже выкладывайте список всех задач вашего проекта.

(3) Ладно не шаблонов этикеток)))

У типовых документов есть шаблон, если его перекопировать, то все права обрезаются, даже если их в группах настроить. Какие там есть нюансы для новых документов?

(6) ты роли что ли новые создаешь?

(7)
Ну естественно. На новые документы новые роли. К роли привязываются ограничения по шаблону. Шаблон зашит в роли для каждого документа. Ссылка на шаблон зашита в виде доступа, чтение там или изменение.

У меня получилось по старинке, если в виде доступа задать прямо ссылку на справочник для ограничения то все работает. Но вот чтобы по нормальному, чтобы ограничения подтягивались из групп доступа, сделать пока не получается

(8) ИдентификаторыМетаданных обновлял?

(9) и уже пора наверное начать вдумчиво читать руководство по правам в документации к БСП.
вот скажем, отсюда начать:
https://its.1c.ru/db/bsp246doc#content:72:hdoc