Добрый вечер! Скажите в чем разница между обычными командами и командами с префиксом FN.Например CloseCheckEx() нормально работает. Для чего нужна FNCloseCheckEx(). Кто что использует?

Для ответа достаточно почитать описание переменной TaxType.

Начнем с того,что команды с префиском фн только для Российских специфичных касс,тогда как команды без префикса работают со всеми кассами от Штрих м для разных стран и эпох
просто,специфичные для онлайн касс поля решили не добавлять в обычные команды,а оставит  только в специальных,например,признак предмета расчета и признак способа расчета
если взять описание драйвера,то там можно обнаружить еще и набор специфичных для белорусских касс команд