Делаю оповещения из 1C в телеграмм. Возник вопрос о безопасности. Насколько понимаю бот виден всем пользователям. Можно ли сделать, чтобы бота выдел определенный круг лиц.

Есть вариант, сделать автотизацию через отправку кодового слова. Но пока смотрю на базовый вариант

и по id пользователя или id чата нельзя узнать номер телефона?

только запрос сделать, а пользователь сам решает делиться с тобой телефоном или геокоординатами или нет

KeyboardButton
request_contact    Boolean    Опционально. Если значение True, то при нажатии на кнопку боту отправится контакт пользователя с его номером телефона. Доступно только в диалогах с ботом.

https://tlgrm.ru/docs/bots/api#keyboardbutton