Вариант 1
ВЫБРАТЬ
    ЗаказНаряд.Ссылка
ИЗ
    Документ.ЗаказНаряд КАК ЗаказНаряд
ГДЕ
    ЗаказНаряд.Основание ССЫЛКА Документ.ЗаказПокупателя
    И ЗаказНаряд.Основание = &Основание


Вариант 2
ВЫБРАТЬ
    ЗаказНаряд.Ссылка
ИЗ
    Документ.ЗаказНаряд КАК ЗаказНаряд
ГДЕ
    ЗаказНаряд.Основание = &Основание


Вариант 3
ВЫБРАТЬ
    ЗаказНаряд.Ссылка
ИЗ
    Документ.ЗаказНаряд КАК ЗаказНаряд
ГДЕ
    (ВЫРАЗИТЬ(ЗаказНаряд.Основание КАК Документ.ЗаказПокупателя)) = &Основание

ЗаказНаряд.Основание - Составной тип - все документы

Пофиг

(0) Не будет разницы

того что будет быстрее здесь нет

(0) при большом количестве документов , любой запрос содержащий ГДЕ будет долгим.

Согласен с (9).
Если с регистром не взлетает - я за вариант (2) из приведенных, но что-то мне подсказывает, что тут можно как-то быстрее. Возможен ли вариант с ВЫРАЗИТЬ не в ГДЕ, как вы думаете? Может это ОНО как раз?

Вариант 4 Внутреннее соединение.

(3) На полупустой базе измерять бессмыссленно. При заполненной базе иногда "неправильные" запросы дадут бОльший эффект.