Если вопрос про разные варианты настройки именно у обработки - не вариантов отчёта, то тут надо программно.
Посмотреть ХранилищеОбщихНастроек и методы Сохранить, Загрузить.
(1) то что появляется колонка СОхранять это классно.
Но
появляется только у реквизитов, у табличных частей нет. У меня есть настройки которые заполняются в табличных частях.
Для этого галок нет.
Опять таки эти галки - при открытии закрытии. Не понятно как сохранить набор одних настроек, потом еще набор этих же настроек в другой комбинации и так далее.