НА ИС (и не только там) есть примеры как найти самые тяжелые/самые долгие и т.п. запросы sql.
Вопрос: а как потом найти этот запрос в коде 1С (откуда он вызван)?
Требовать и эффективности, и гибкости от одной и той же программы — все равно, что искать очаровательную и скромную жену... по-видимому, нам следует остановиться на чем-то одном из двух. Фредерик Брукс-младший