Введен "Ввод начальных остатков НДС".
"Заполнить" - "Сформировать счета фактуры" сделано.
Счета фактуры на аванс сформированы.
Проблема в том, что в обработку регистрации счетов фактур на аванс следующего периода снова попадают эти начальные остатки.
Где копать?

Рассмотри регистр НДС с авансов. Сделай все группировкии, последняя сф, посмотри почему не закрывается по группировке Счет-фактура

Есть только движения "Приход" по регистратору "Ввод начальных остатков НДС"

(0) ну ответ то очевиден
без правильного ввода взаиморасчетов в Рг Расчеты по реализации кина не будет

а ошибка скорее всего в документе расчетов

Каким документом регистрируется "Расход" по начальным остаткам в регистре "НДС с авансов"?

в документе ввод начальных остатков по взаиморасчетам выбери Документ расчетов с контрагентом (ручной учет) который сформировался в документе Ввод начальных остатков по НДС

Проблема была в том, что в вводе начальных остатков по взаиморасчетам были неправильно указаны "Документы расчетов с контрагентом"
Спасибо!