Столкнулся с проблемой.
Думал все... пропало хранилище.
Проверка chdbfl.exe говорила что ошибок нет.
Но сделать сравнение основной конфигурации и конфигурации хранилища не получалось. Появлялась ошибка "Ошибка при выполнении файловой операции".
Как удалось решить.
Зашел в историю хранилища.
Пытался открыть конфигурацию последней версии. Ошибка.
Пытался открыть конфигурацию предпоследней версии. Открылась.
После этого открываю последнюю версию - открывается.

Проблема точно не в кэше. Проверка делалась на 3 разных компьютерах с чисткой кэша.