Оказалось что в типовой бухии 3.0 типовая обработка по восстановлению косячит (в проводкаx в измерении Подразделение вместо Неопределенно ставить Подразделение.ПустаяСсылка() из-за этого летят к чертям партии, остатки и прочая хрень). Возможно ли перехватить обработку проведения метода ВосстановитьПоследовательность?

(0) нет
и скорее всего это следствие кривого обновления и лечиться либо ТиИ, либо перезагрузкой в идентичную