есть ссылка необходимо проверить есть ли данный элемент в справочнике.Т.е возможно он был раньше безвозвратно удален.

жесть.

Откуда у тебя будет ссылка если нет элемента?

может быть только <Объект не найден...>, но это не ссылка

это битый указатель.

Попытка
  А = ТвояСсылка.ПолучитьОбъект();
Исключение
  Сообщить("Нет объекта!");
КонецПопытки;

(3) ты прав не ссылка а <Объект не найден...>, вот надо список всех таких.

(6)в справочнике?

Книга знаний: Пустые ссылки

Выбрать
 Спр.ссылка
Из Справочник.Какойто КАК Спр
ГДЕ Спр.Ссылка Есть NULL
И Спр.Ссылка <>ЗНАЧЕНИЕ(Справочник.Какойто.Пустаяссылка)

только так наверное не пойдет, надо выбирать не справочник, а объекты где они используются

из документов выбирать или регистров

Выбрать
 Док.РеквизитСпр
Из Документ.Какойто КАК Док
ГДЕ Док.РеквизитСпр.Ссылка Есть NULL
И Док.РеквизитСпр <>ЗНАЧЕНИЕ(Справочник.Какойто.Пустаяссылка)