То ли я туплю, то ли задача нетривиальная ..

Есть справочник  Спр.  У него есть ТЧ "Контрагенты". В ТЧ есть реквизит "Контрагент", который может быть и либо элементом либо группой справочника "контрагенты".

Как по параметру запроса "ВыбКонтрагент"
отобрать все элементы справочника у которых в ТЧ есть элемент в котором указана группа в которую данный контрагент входит.

Как то так вроде

ВЫБРАТЬ
  СпрТабл.Ссылка
ИЗ
  Справочник.НазваниеСправочника.Таблица как СпрТабл
ГДЕ
  СпрТабл.Контрагент В ИЕРАРХИИ(&ВыбКонтрагент)
СГРУППИРОВАТЬ ПО
  СпрТабл.Ссылка

Ну простой вариант, загнать в список сам параметр и всех родителей верхнего уровня для параметра и в запрос передать список

и Где ... В (&Список)

у ссылки справочника есть такой метод ПринадлежитЭлементу

(3) Продолжай.
Или нет. Лучше не продолжай.