А что, где-то это настраивается? Можно отключить определенные документы, чтобы записи по ним не попадали в журнал?

нельзя отключить выборочно. Фильтр стоит поди?

Глобальный контекст.УстановитьИспользованиеЖурналаРегистрации (Global context.SetEventLogUsing)
Глобальный контекст (Global context)
УстановитьИспользованиеЖурналаРегистрации (SetEventLogUsing)
Синтаксис:

УстановитьИспользованиеЖурналаРегистрации(<Уровни>)
Параметры:

<Уровни> (обязательный)

Тип: Массив.
Массив уровней важности регистрируемых событий.
Состоит из значений типа УровеньЖурналаРегистрации.
Пустой массив означает, что никакие события регистрировать не надо.
Помимо пустого массива, допускаются следующие наборы значений:
Ошибка;
Ошибка, Предупреждение;
Ошибка, Предупреждение, Информация;
Ошибка, Предупреждение, Информация, Примечание.
Порядок значений в массиве не существенен.