Если перенесем зуп за январь из семерки потом сможем нормально отчетность сдавать за 2013 год?

Если в ЗиК все правильно, то и перенесется все правильно, и сдавать отчетность из ЗУП можно.
Только не бывает в ЗиК все правильно.

(0) нет

(2) Как нет, когда да? :)

(3) нужно переносить и начисления и отработанное за 2 года. Кроме того нужно переносить начальное сальдо и по начислениям и по отпускам

(4) Так оно переносится все.

(4) (2) ну кикто же не мешает считать среднее вручную, если правильно посчитают, то и отчетность правильно сдадут.