Как лучше всего при проведении документа создавать его копию но уже по другой организации?

Регл. задание

Т.е. не при проведении а по таймеру

подпиской на событие

Я тоже склоняюсь к подпискам, думаю заполнять их так. Как сменить организацию, еще думаю

Выборка = Документы.НашДок.Выбрать();
Пока Выборка.Следующий() Цикл
НовыйДокумент = Документы.НашДок.СоздатьДокумент();
ЗаполнитьЗначенияСвойств(Выборка.Ссылка, НовыйДокумент);
НовыйДокумент.Записать();
КонецЦикла;

(3) (4) подпиской на какое событие ??

(5) ну наверное, логично было бы на проведение

(4) не надо никаких "Выборка"
посмотри параметры процедуры-обработчика

только добавь какой-нибудь реквизит в документ, чтоб показать, что эт копия. Иначе у тебя бесконечно будут документы дублироваться) что-то типа того:
Процедура ПриПроведенииТвоегоДокумента(Источник, Отказ, РежимПроведения) Экспорт
 Если Не Источник.ЭтоКопия Тогда
   НовыйДокумент = Источник.Скопировать();
   НовыйДокумент.Организация = ДругаяОрганизация;
   НовыйДокумент.ЭтоКопия = Истина;
   .....................