В список документов добавил колонку с галками, к данным не привязана. Она нужна для выделения галками документов, чтобы дальше "по кнопке" их обработать. Сделал немного извратно, но работает: при установке галки в процедуре ПриИзмененииФлажка запоминаю/удаляю строчку из массива.
После нажатия кнопки галки надо снять програмно, а вот тут засада, не получается. Пробовал так:
ЭлементыФормы.Список.ОформлениеСтроки(СтрокаТЧ).Ячейки.Пометка.Флажок = 0;

Ошибку не выдает, но и флажок не скидывает. Что я делаю не так?

[Сделал немного извратно]

(1) сильно извратно? :) Другого способа с галками в стандартном списке документов не придумал.

режим выделения покури

(3) Множественный имеете ввиду? Знаю про это, сначала так сделал, но заказчику неудобно, захотел галками...

Попробуй
ЭлементыФормы.Список.ОформлениеСтроки(СтрокаТЧ).Ячейки.Пометка.Флажок = ЛОЖЬ;