Данные:
Сервер терминалов на Win2008
Клиенты на Ubuntu

Когда клиенты на Win - в свойствах подключения в локальных ресурсах ставишь галки на дисках с которыми нужен буфер обмена и копипаст работает.

В убунте аналогов подобного вообще не нашел. Есть тема "Общая папка" - но при попытках что либо сделать (копипаст) - соединение отваливается

точнее не соединение а подключенная папка

как решить проблему обмена файлами?

юзай remmina. там есть в настройках все что необходимо

(0) rdesktop?

-r disk:<sharename>=<path>

но стабильнее использовать шары через самбу (например сетевой диск юзера)

да... линукса - это для любителей поизвращаться...