Несколько раз сталкивался с непонятным поведением конфигуратора при обновлении.
Платформа 8.2.15.301
Есть две идентичных базы. В одной из них правлю конфигурацию: модуль документа и общий модуль. Меняю заголовок конфы.
Сохраняю конфигурацию в файл.
После этого во второй базе загружаю новую конфигурацию из файла.

Документ и заголовок меняются, а общий модуль - нет.
Делаю Сравнить-объединить. Показывает что различий в конфигурациях нет.

В первой базе ещё раз меняю заголовок конфы, в общем модуле добавляю-удаляю пробел. Сохраняю конфу.

Во второй базе делаю Сравнить-объединить. Вижу отличия и успешно объединяю.

Сижу и офигеваю.
Конечно, теперь буду каждый раз дважды проверять, всё ли перенеслось в базу из файла конфигурации, а также попробую повторить ситуацию экспериментальным путем.

Но, возможно не один я такой "счастливчик". У кого есть подобный опыт?