Просто вручную почиститить?

(0)Пометить на удаление , потом Операции->Удаление помеченных объектов.

Если перспектива заиметь битые ссылки в базе не страшит,то можно просто программно побить через  .Удалить(1)

ок

(0)
Док=СоздатьОбъект("Документ");
Док.ВыбратьДокументы(Дата1,Дата2);
Пока Док.ПолучитьДокумент()=1 Цикл
   Док.Удалить(0);
КонецЦикла;
Пометит на удаление ВСЕ документы в периоде [Дата1,Дата2].

спс