Гуглил, и искал на мисте, не смог найти.

Хотелось бы в зависимости от условия менять существующий текст запроса к динамическому списку из модуля формы.

а куда у Вашего ДинамическогоСписка исчезло св-во ТекстЗапроса ?

(1) как обратиться программно к этому свойству ?

Вот кому надо:

&НаСервере
Процедура ПриСозданииНаСервере(Отказ, СтандартнаяОбработка)
   //Вставить содержимое обработчика
   

   Список.ТекстЗапроса = "";

КонецПроцедуры

(1) спасибо за наводку