Вызываю:
plink <сервер> -ssh -l <логин> -pw <пароль>
Using username "<логин>.
Access granted. Press Return to begin session.

далее пишу:
cd $bin
pwd

получаю каталог 1

Если вызываю:
plink <сервер> -ssh -l <логин> -pw <пароль> (cd $bin;pwd)
Access granted. Press Return to begin session.

получаю каталог 2

В параметрах рыл, нет объяснения, может кто знает, почему так?

А если cd $bin;who
сказать?
Или cd $bin;$HOME

(0) $bin до и после логина разные

who выводит несколько сессий, IP адресов
при ручном вводе на один больше

$HOME в обоих случаях одинаково
-bash: <каталог> is a directory

(2) логично, но команды вызываются после авторизации

(4) после авторизации вызывается logon скрипт, ты попадаешь с этими командами до него и после

(5)+ самый прикол что на разных linux устройствах может быть разное поведение

(5) https://zalinux.ru/?p=3127

(6) можно вызвать команды после авторизации через plink?

(8) из скрипта? конечно

понял что это Login shell и Non login shell
подскажите, как правильно вызывать в Non login shell?

попробуй через sh или описание/ключики plink

самый простой, но плохой вариант sendkeys в putty(Login shell)

(11) я не могу создавать на сервере свои файлы, курю ключи

ssh соединение не только через plink можно
во многих ЯП готовое

чем сейчас модно запускать sh на удаленном сервере, с Login shell?
потому что, как я понял sh использует переменные среды которые видны только в нем

(15) запускать буду из 1С

https://wonderland.v8.1c.ru/blog/podderzhka-ssh-v-1s-ispolnitele/