При проведении списания с расчетного счета сумма разбивается на две проводки, из-за документов расчета.. Проблема с др тянется ещё с перехода с 1.6. Что тут можно предпринять? Как настроить автоматическое отнесение только на один документ расчетов?

никак

в 2.0 третье субконто на счетах расчетов с контрагентами обязательное

я понимаю что обязательное, почему на разные доки вешаются суммы? Одна сумма в документе разбивается автоматически на две проводки, по док-м расчетов. Это происходит, я так понимаю, потому что по этим контрагентам и договорам были сформированы доки расчетов ещё при переносе и вводе нач.остатков
Но вот как теперь быть)
Забивать не хотелось бы

ну уйдут долги по старым документам, будет нормально

а почему ты решил что вся сумма должна пройти по одному документу?

позови специалиста ;)

(5) я не решил, никак не вникну собственно в документы расчетов. Они же тянутся ещё из регистров ндс, вроде, из 1.6
с другой стороны, не совсем понятно, откуда в течение года берутся новые документы расчетов по контрагенту-договору, и почему в итоге все неправильно зачитывается.
Вот в данном случае заплатили за услуги, проводка разбилась на две.
За списанием последовало поступление, одной проводкой, на ту же сумму(целиком)

(7) продолжайте наблюдения!

(7) обращайся к маньяку, он как раз открывает для таких как вы специальную фирму по устранению косяков в учете.

(9) ну он же тока партии правит, а тут документы расчетов - не его профиль

ну пока не открылась - тут совета поспрашиваю